答：(1)任务目标不同。BOT提交的是具体工程，PFI模式政府只提出具体的功能目标，通常情况下PFI合同都会对最终产品作明确定义，而对如何实现最终的产品PFI合同一般不做具体说明，比如只会提出总体要求建一条新的公路，解决交通拥挤问题，会提出几套方案，而不会具体指定，最终方案则在谈判过程中通过与私人企业协商确定。
(2)主体不同。国内实践中，BOT模式的项目主体多为外商直接合作，PFI主要集中于国内民间资源。
(3)适用范围不同。BOT应用于收益性较高的基础设施建设，而PFI由于自身的特点，既可以应用于收益性较高的基础设施建设，也可以应用于受益性高的基础设施建设和社会公益项目。
(4)承担风险不同。BOT不承担设计风险，而且经常约定最低合作回报率，而且在BOT模式中，一般都需要政府对最低收益等做出实质性的担保；PFI相应来说没有这种保证。
(5)合同期满后项目运营权的处理方式灵活。PFI模式在前期合同谈判中就要明确合同期满后，如果私人企业通过正常经营未达到合同规定的收益，则可以继续拥有或通过续租的方式获得运营权。